<div dir="ltr">Hi all<div><br></div><div> You will be working in groups to put together your pipelines. Here is one paper that outlines a pipeline with the tophat, cufflinks, cuffdiffs and some associated R scripts.</div><div>
<br></div><div>ID<br clear="all"><div><br></div>-- <br>Ian Dworkin<br>Associate Professor<br>Department of Zoology<br>Program in Ecology, Evolutionary Biology &amp; Behaviour<br>Program in Genetics<br>Michigan State University<br>
office (517) 432-6733<br>lab (517) 432-6730<br><a href="mailto:idworkin@msu.edu" target="_blank">idworkin@msu.edu</a><br><a href="https://www.msu.edu/~idworkin/" target="_blank">https://www.msu.edu/~idworkin/</a>
</div></div>