<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div class="">Just a thought, but anything that is using TSLR/Moleculo? &nbsp;I recall khmer being part of the pipeline...</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">chris</div>
<br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Jun 3, 2015, at 9:26 AM, C. Titus Brown &lt;<a href="mailto:ctbrown@ucdavis.edu" class="">ctbrown@ucdavis.edu</a>&gt; wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class=""><span style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">heh,
 ok, thanks! &nbsp;I'll have to dig into this.</span><br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">cheers,</span><br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">--titus</span><br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">On
 Wed, Jun 03, 2015 at 02:16:13PM &#43;0000, Richard Smith-Unna wrote:</span><br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<blockquote type="cite" style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
OK yeah I forgot Khmer is a people, region and language. With a basic<br class="">
filter:<br class="">
<a href="http://europepmc.org/search?query=(METHODS%3A%22khmer%22)%20NOT%20%22Cambodia%22" class="">http://europepmc.org/search?query=(METHODS%3A%22khmer%22)%20NOT%20%22Cambodia%22</a><br class="">
down to 72. But still - you're missing dozens from your list :)<br class="">
<br class="">
On Wed, Jun 3, 2015 at 3:13 PM Richard Smith-Unna &lt;richardsmith404@gmail.com&gt;<br class="">
wrote:<br class="">
<br class="">
<blockquote type="cite" class="">You've only recorded 4 paper making use of khmer - but there are 185<br class="">
citing khmer in their methods section in Europe Pubmed Central (<br class="">
http://europepmc.org/search?query=%28METHODS:%22khmer%22%29&amp;page=1). And<br class="">
given that only about 20% of biomed papers are searchable in that way - one<br class="">
could safely infer the real number is considerably higher.<br class="">
<br class="">
On Wed, Jun 3, 2015 at 3:08 PM C. Titus Brown &lt;ctbrown@ucdavis.edu&gt; wrote:<br class="">
<br class="">
<blockquote type="cite" class="">Hi all,<br class="">
<br class="">
I???m putting together a renewal request for the main khmer funding (NIH<br class="">
R01), and so I???m gathering information on users and citations.<br class="">
<br class="">
So, a few requests ???<br class="">
<br class="">
1. If people have found khmer (diginorm or something else) particularly<br class="">
useful and would be interested in contributing a letter of support, please<br class="">
let me know! I???m particularly interested in letters from technical and<br class="">
biomedical groups, but everything counts.<br class="">
<br class="">
2. I???ve been updating citation information, and I???d appreciate pointers<br class="">
to any papers you know of that have used khmer.<br class="">
<br class="">
Here are the collections I have so far:<br class="">
<br class="">
* biological uses outside of the group:<br class="">
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/1ruvipqAmaMkN/collections/48107393/public/<br class="">
* tools building on khmer concepts:<br class="">
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/1ruvipqAmaMkN/collections/48101567/public/<br class="">
* papers in collaboration with our group:<br class="">
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/1ruvipqAmaMkN/collections/48107445/public/<br class="">
<br class="">
3. Any other comments you have regarding what is working, what would be<br class="">
nice to fix or update, etc. etc. would be most welcome - publicly or<br class="">
privately, quotable or not.<br class="">
<br class="">
thanks,<br class="">
???titus<br class="">
<br class="">
<br class="">
_______________________________________________<br class="">
khmer mailing list<br class="">
khmer@lists.idyll.org<br class="">
http://lists.idyll.org/listinfo/khmer<br class="">
<br class="">
</blockquote>
<br class="">
</blockquote>
</blockquote>
<br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">--<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span></span><br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">C.
 Titus Brown,<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span></span><a href="mailto:ctbrown@ucdavis.edu" style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">ctbrown@ucdavis.edu</a><br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">khmer
 mailing list</span><br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="mailto:khmer@lists.idyll.org" style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">khmer@lists.idyll.org</a><br style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="http://lists.idyll.org/listinfo/khmer" style="font-family: Menlo-Regular; font-size: 11px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">http://lists.idyll.org/listinfo/khmer</a></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</body>
</html>