<div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Hi again,<br><br></div>I&#39;m advancing by piecing together snippets from all the available scripts. One question though. <br><br></div>Does K have an upper limit? Loading a counting hash with K=31 and everything is fine, but with K=41 the following error appears:<br>
<br>python: ktable.cc:21: khmer::HashIntoType khmer::_hash(const char*, khmer::WordLength, khmer::HashIntoType&amp;, khmer::HashIntoType&amp;): Assertion `k &lt;= sizeof(HashIntoType)*4&#39; failed.<br></div>Aborted<br><br>
</div>Or is this due to only using one strand? The code looked like a limitation.<br><br>Best,<br><br></div>Karl<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jul 29, 2013 at 6:25 PM, C. Titus Brown <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ctb@msu.edu" target="_blank">ctb@msu.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="im">On Mon, Jul 29, 2013 at 05:35:13PM +0200, Karl Nordstr?m wrote:<br>
&gt; thank you very much. My intent was to write a simple filter with the help<br>
&gt; of the data structures, not anything fancy. Learn how to make use of this<br>
&gt; resource.<br>
&gt;<br>
&gt; I will try and see what happens.<br>
<br>
</div>Cool -- let us know how it works out ;)<br>
<br>
cheers,<br>
--titus<br>
</blockquote></div><br></div>